Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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