Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAB23Q9ULC3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB23Q9ULC3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms