Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RABGEF1Q9UJ41 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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RABGEF1Q9UJ41 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RABGEF1Q9UJ41 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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