Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KDM5BQ9UGL1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms