Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK3Q9UBP4 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms