Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPASTQ9UBP0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms