Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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