Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRIT1Q9P2V4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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LRIT1Q9P2V4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRIT1Q9P2V4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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