Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
USP35Q9P2H5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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