Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HCN3Q9P1Z3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HCN3Q9P1Z3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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