Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C1orf109Q9NX04 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C1orf109Q9NX04 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms