Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms