Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COG4Q9H9E3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms