Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCSER1Q9C0I3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CCSER1Q9C0I3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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