Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CNTNAP3Q9BZ76 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNTNAP3Q9BZ76 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNTNAP3Q9BZ76 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CNTNAP3Q9BZ76 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms