Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCAPERQ9BY12 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCAPERQ9BY12 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms