Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BRIP1Q9BX63 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms