Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
HIGD2AQ9BW72 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms