Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms