Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
ZNF479Q96JC4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
ZNF479Q96JC4 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms