Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG2BQ96BY7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms