Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKD2Q969F2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms