Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDDC3Q8N4P3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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