Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SLC22A9Q8IVM8 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms