Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms