Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HECW1Q76N89 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HECW1Q76N89 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms