Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
BEND4Q6ZU67 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BEND4Q6ZU67 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms