Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2M8

PNCK, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCKQ6P2M8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PNCKQ6P2M8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PNCKQ6P2M8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms