Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KRT80Q6KB66 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms