Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM46CQ5VWP2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms