Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTXN3Q4LDR2 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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