Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL40Q2TBA0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL40Q2TBA0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms