Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGSM1Q2NKQ1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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