Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HADHQ16836 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HADHQ16836 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HADHQ16836 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HADHQ16836 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms