Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SKIV2LQ15477 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms