Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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PTPRKQ15262 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRKQ15262 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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