Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
SSPNQ14714 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
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SSPNQ14714 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SSPNQ14714 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
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