Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
APOFQ13790 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
APOFQ13790 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
APOFQ13790 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
APOFQ13790 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
APOFQ13790 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms