Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNA1SQ13698 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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