Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTCH1Q13635 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTCH1Q13635 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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