Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CUL4BQ13620 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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