Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TCIRG1Q13488 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TCIRG1Q13488 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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