Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PMS2P3Q13401 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
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