Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGCGQ13326 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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SGCGQ13326 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGCGQ13326 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SGCGQ13326 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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