Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DUSP4Q13115 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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