Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
NPRL3Q12980 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NPRL3Q12980 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms