Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FOXF2Q12947 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FOXF2Q12947 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms