Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KIF5AQ12840 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms