Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUP160Q12769 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms