Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FMODQ06828 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FMODQ06828 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms